mada
Via Clipboard
Analysis:
Diagnostic Test Accuracy (DTA)研究のメタアナリシス。Bivariate modelによるHierarchical summary ROC解析。
Dependent package:
"mada"
packneed=c("mada") current=installed.packages() addpack=setdiff(packneed,rownames(current)) url="https://cran.ism.ac.jp/" if(length(addpack)>0){install.packages(addpack,repos=url)} if(length(addpack)==0){print("Already installed.")}
*青のボタンをクリックして、Rに戻って、Rエディタ中のVia Clipboardの#2のスクリプトを実行することによって、必要なパッケージがインストール済みかチェックし、未インストールの場合は自動でインストールする。（インターネット接続の環境が必要）。
Data:
データを一定の形式でExcelで用意する。解析実行の際には、データ範囲をコピーして、Rに戻り、Rエディタ中のVia Clipboardスクリプトの#1を実行してデータを読み込む。
names TP FP FN TN Theron 2013 154 27 31 517 Malbruny 2011 12 0 0 46 Boehme 2011e 101 16 0 671 Boehme 2011b 171 3 6 825 Boeheme 2010b 201 0 8 101 Ciftci 2011 24 1 1 59 Boehme 2010e 179 0 8 35 Bowles 2011 60 2 4 23 Boehme 2010c 136 1 10 185 Miller 2011 27 2 2 58 Boehme 2011e 136 5 12 234 Ioannidis 2011 29 2 3 32 Teo 2011 56 2 6 42 Hanif 2011 54 0 6 146 Marlowe 2011 116 4 14 82 Boehme 2011a 203 4 26 303 Zeka 2011 31 0 4 68 Scott 2011 58 3 9 104 Boehme 2011c 201 2 32 669 Rachow 2011 49 1 9 101 Boehme 2010d 36 3 7 215 Boehme 2011a 123 1 24 68 Boehme 2011d 121 0 24 144 Helb 2010 67 0 15 25 Theron 2011 111 19 30 320 Moure 2011 61 0 17 29 Lawn 2011 42 2 30 320
*青のボタンをクリックして、Excelに貼り付ける（Ctrl+V)と形式がわかる。
Output:
Forest plot and funnel plot.
Operational script:
###dta meta-analyis with mada source("http://zanet.biz/med/useRj/scripts/dta_ma_mada.R")
*Excelでデータ範囲を選択し、コピーし、RでRエディタ中のVia Clipboardの#1のスクリプトを実行することで、解析対象のデータを読み込んだ後、 青のボタンをクリックして、Rに戻り、RでRエディタ中のVia Clipboardの#2のスクリプトを実行すると結果が表示される.
**上記のDataフィールドをコピーした場合には、コピー操作後に、Rに戻りRエディタ中のVia Clipboardのスクリプト#1を実行し、もう一度この画面に戻り、このフィールド内をすべて選択して、青のボタンをクリックして、RでRエディタ中のVia Clipboardの#2のスクリプトを実行する。